Alphas est une série de science-fiction axée sur une brigade secrète du gouvernement recrutant des individus aux capacités hors du commun, appelés Alphas. Cette section a pour objectif de repérer les Alphas aux mauvaises intentions et doit combattre contre son principal ennemi qui est un groupe terroriste appelé "Drapeau rouge", luttant pour l'indépendance des Alphas, allant jusqu'au crime pour arriver à leurs fins.